隨著工農業的發展，千千的化學物質被排放到水中，但是僅通過監測特定的理化指標難以全面評價水污染情況。而水質生物毒性檢測與常規理化監測相比，可以全面、直觀、快速地評價水體污染狀況，彌補理化指標監測的不足。之前環境部發布的《應對新型冠狀病毒感染肺炎疫情應急監測方案》也新增了水質生物毒性檢測和余氯檢測，主要用于保障供水安全，預警突發環境污染事件、醫療廢水非法排放、消毒產品大量使用引發的次生環境災害。水質生物毒性檢測不僅是疫情防控過程中的監測指標，也將在未來水環境預警系統的建設中作為一種預警手段發揮不可磨滅的作用。
水質生物毒性檢測方法參照的標準是《水質 急性毒性的測定 發光細菌法》，這個方法是一種以明亮發光桿菌作為受試生物，以氯化汞作為參比毒物的水樣急性毒性快速檢測方法。基于明亮發光桿菌相對發光度與水樣毒性組分總濃度呈顯著負相關性，通過生物發光光度計測定水樣的相對發光度，計算其急性毒性水平。水質急性毒性水平選用相當的參比毒物氯化汞濃度來表征，或選用EC50值（半數有效濃度-以樣品液百分濃度為單位）來表征。
讓受試生物暴露在被測水樣中，根據觀察到的受試生物的反應（例如死亡、行為異常、生理特征變化等）作出的水樣對受試生物的負面影響的評價。根據受試生物不同，水質生物毒性檢測常見標準如下：
在水質生物毒性檢測中，《水質 急性毒性的測定 發光細菌法》GB/T 15441-1995與《費氏爾弧菌 水質樣品光抑制的測定》ISO-11348-3都可以用于重金屬、有機污染物、農藥等有毒有害物質的預警監測。這兩種水質生物毒性檢測標準所基于的基本原理一致：都是通過檢測水樣中毒性物質對發光細菌發光效應的抑制作用來反映水樣毒性水平；且都采用海洋中提取的發光細菌作為受試微生物，檢測方法及檢測結果趨勢具有一致性。兩種方法目前都是生態環境部門常用的生物毒性檢測手段，都可在實驗室條件下作為急性毒性測定方法也可以作為在線手段實時監控預警。
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